留言咨询 留言咨询

信息中心

首页>>信息中心>>标准化流程与成功技术案例

标准化流程与成功技术案例

RNA提取及反转录

发布时间:2017-06-30 16:46:49    阅读次数:4619  

1. RNA提取

1.1 细胞裂解或组织匀浆。

1.1.1 贴壁细胞:吸尽培养液,每10 cm2细胞加入1 mL Beyozol。一般六孔板每孔加1mL,12孔板每孔加 0.5mL。晃动3-5下,再用枪吹打2-3下,确保全部裂解,然后吸至离心管中。

1.1.2悬浮细胞:离心收集细胞,吸尽液体,每五百万至一千万动植物或酵母细胞,或一千万细菌,加入1 mL Beyozol。用枪吹打或适当vortex确保全部裂解。某些酵母和细菌如裂解不充分,可用匀浆器匀浆,确保全部裂解。

1.1.3 组织:先将新鲜组织剪切成小块,放入普通玻璃匀浆器内,冰浴,加入适量Beyozol,匀浆。冻存组织需放入液氮研磨成粉末,加入适量Beyozol。每50mg-80mg组织加入1mL Beyozol。

1.2对于某些蛋白,多糖或脂含量很高的细胞或组织,Beyozol 裂解后可能会有不溶物或油脂状漂浮物。需12,000×g 4℃ 离心10min,然后吸取澄清的Beyozol裂解产物至一新的离心管中。

1.3 室温放置5min,使样品充分裂解。

1.4 每毫升Beyozol加入0.2mL氯仿,vortex混匀或猛烈晃动15s,室温放置2-3min。

1.5 12,000×g 4℃离心15min,然后吸取含总RNA的上层水相至一新的离心管中,每毫升Beyozol约可吸取0.5-0.55mL。

1.6 按每毫升最初的Beyozol加入0.5mL异丙醇,颠倒数次混匀,室温沉淀10min。

1.7 12,000×g 4℃离心10min,在管底可见胶状RNA沉淀,弃上清。

1.8 每毫升最初的Beyozol加入1mL75%乙醇,vortex或颠倒混匀,

1.9 7,500×g 4℃离心5min,弃上清。再用离心机甩一下(>5,000rpm, 离心1s),小心吸尽液体。

1.10待RNA略干后,加入20微升DEPC水溶解,-70℃冻存。注意,切勿让RNA过分干燥,否则将极难溶解,且测出的A260/280值会低于1.6。

1.11注意事项:

所有离心管,枪头及相关溶液都必需无 RNA酶污染。耐高温器物可 150℃烘烤4h以除去 RNA酶,其它器物除RNA酶可考虑蒸水用0.01%的DEPC水浸泡过夜,然后灭菌,烘干。溶液需用 DEPC水配制。加0.01% (体积比) diethylpyrocarbonate(DEPC)至重或MiliQ级水中,处理过夜,灭菌即成DEPC水。

必需戴无尘一次性手套操作,且尽量不要对着RNA样品呼气或说话,以防RNA酶污染。

Beyozol含有毒物质苯酚,避免接触皮肤或吸入。为防止溅入眼睛,请戴防护眼镜或使用透明保护屏。如皮肤接触 Beyozol,请立即用大量去垢剂和水冲洗,如仍有不适,请听取医生意见。

需自备氯仿,异丙醇,75%乙醇(DEPC水配制),和DEPC水。

Beyozol抽提总RNA的同时,理论上也可抽提蛋白和DNA,但尚未经测试。有兴趣者可按Trizol的操作步骤进行操作。

具体试验方法亦可参考各自RNA提取试剂盒。

2.  RNA质量检测

2.1 紫外吸收法测定

先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度。使用仪器为天根微量分光光度计,操作详见“TGem Spectrophotometer 超微量分光光度计(OSE-260)操作流程”。

纯度检测:RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1。

2.2 变性琼脂糖凝胶电泳测定

制胶:1g琼脂糖溶于适量TAB缓冲液中,微波炉加热至完全融化,冷却至60℃,加入EB,灌制凝胶板,胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1×TAB电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米。

RNA样品处理:取3μL RNA样品,加3倍体积的甲醛上样染液,变性15min,上样。

电泳:上样前凝胶需预电泳5min,随后将样品加入上样孔。5-6V/cm电压下2h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少2-3cm。

观察并拍照:具体操作流程见“美国BIORAD凝胶成像基本操作流程”。

28S和18S核糖体RNA的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍。还有可能观察到一个更小稍微扩散的带,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖体RNA)组成。在18S和28S核糖体带之间可以看到一片弥散的EB染色物质,可能是由mRNA和其它异型RNA组成。RNA制备过程中如果出现DNA污染,将会在28S核糖体RNA带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,RNA的降解表现为核糖体RNA带的弥散。用数码照相机拍下电泳结果。

3. cDNA合成

样品cDNA合成,一般根据cDNA转录试剂盒操作步骤完成后,cDNA备用。

参考流程如下:反应体系,包括逆转录buffer、上游引物、下游引物、dNTP、逆转录酶MMLV、DEPC水和RNA模版根据要求混匀,瞬时离心。混合液在加入逆转录酶MMLV 之前先70℃干浴3min,取出后立即冰水浴至管内外温度一致,然后加逆转录酶0.5μL,37℃水浴60min。取出后立即95℃干浴3min,得到逆转录终溶液即为cDNA溶液,保存于-80℃待用。